Theo điều lệ giải, vòng loại với sự góp mặt của 5 đội Thái Sơn Bắc, Quảng Nam, Tân Hiệp Hưng, Sanna Khánh Hòa và Cao Bằng. Các đội thi đấu vòng tròn 1 lượt chọn 3 đội có thành tích tốt nhất vào vòng tiếp theo. Kết quả, các đội Thái Sơn Bắc, Tân Hiệp Hưng và Cao Bằng đã giành vé đi tiếp.
Giai đoạn 2 sẽ diễn ra từ ngày 26-30/11 với sự tham dự của 8 đội bóng. Ngoài 3 đội vượt qua giai đoạn 1 kể trên còn có 5 đội có thứ hạng từ 1 đến 4 của giải Futsal Vô địch quốc gia HDBank 2019 là Thái Sơn Nam, Savinest Sannatech Khánh Hòa, Kadichain Saigon FC, Đà Nẵng và đội chủ nhà SHK Nghệ An. Các đội sẽ bốc thăm chia thành 4 cặp thi đấu, các đội thắng sẽ thi đấu bán kết, chung kết để xếp hạng từ 1 đến 4, các đội thua sẽ thi đấu để xếp hạng từ 5 đến 8.