Có 2 phương án thi đấu được VPF đưa ra theo như kế hoạch trước đó. Phương án 1 là vẫn giữ nguyên thể thức thi đấu 2 lượt trên sân nhà và sân đối phương như cũ, giữ nguyên kết quả của 2 vòng đã thi đấu. Phương án 2 là các đội thi đấu vòng tròn 1 lượt, sau khi kết thúc sẽ căn cứ vào bảng xếp hạng chung cuộc giai đoạn 1. Ở giai đoạn 2 sẽ phân theo 2 tốp, 8 đội có thứ hạng cao nhất sẽ thi đấu ở tốp tranh vô địch, và 6 đội còn lại thi đấu ở tốp tranh trụ hạng. Phương án này cũng giữ nguyên kết quả của 2 vòng đã thi đấu trước đó.
Chủ tịch Công ty VPF Trần Anh Tú nêu những phương án tại buổi họp. Phương án 2 sau cùng được chọn qua phần biểu quyết. Giải sẽ trở lại từ ngày 5-6 và thi đấu đến ngày 25-10-2020 với 2 giai đoạn như đã nêu. Giải hạng Nhất quốc gia LS 2020 sẽ thi đấu từ ngày 6-6 đến 26-9 cũng với 2 giai đoạn. Giai đoạn 1 mang tính chất phân nhóm với 11 vòng đấu (đá vòng tròn giữa 12 đội). Sau đóm 6 đội xếp hạng từ 1 đến 6 sẽ vào nhóm A ở giai đoạn 2 tranh ngôi vô địch; 6 đội còn lại vào nhóm B tranh trụ hạng.
Bên cạnh đó, Hội nghị đã tiến hành biểu quyết và 14/15 đại biểu có mặt đã thống nhất, chỉ có 1 suất xuống hạng. Ngoài ra, VFF cũng thông qua quy định mỗi đội được thay thế 5 cầu thủ/trận.
