Theo kế hoạch ban đầu, AFC Cup 2021 được khởi tranh vào cuối tháng 6. Trong đó 2/3 bảng của khu vực Đông Nam Á diễn ra tại Singapore. Bên cạnh bảng còn lại có sự tham dự của CLB Hà Nội thì chưa xác định được địa điểm thi đấu do không có CLB nào ở bảng này đứng ra xin đăng cai theo hình thức thi đấu tập trung.
Hai tuần trước ngày giải khai mạc, Singapore bất ngờ trả lại quyền đăng cai cả hai bảng do tình hình dịch Covid-19 tái bùng phát ở quốc gia này. Tình hình trên làm AFC bị động trong việc tổ chức và tính đến phương án cuối cùng là mời các CLB Indonesia đứng ra đăng cai cả 3 bảng, nếu không có được cái gật đầu thì khả năng 3 bảng khu vực Đông Nam Á của AFC Cup 2021 có thể bị huỷ.
Thậm chí CLB Hà Nội lâu nay còn chưa biết sẽ dự AFC Cup 2021 ở đâu Điều mà Công ty VPF và Ban điều hành các giải chuyên nghiệp Việt Nam 2021 lo ngại là nếu AFC Cup vận hành vào khoảng tháng 7 hay 8 thì sẽ khó cho kế hoạch của LS V-League 2021 nếu được trở lại vào cuối tháng 7 như kế hoạch. Bởi nếu sang Indonesia dự giải, khi trở về thì cầu thủ hai đội Hà Nội FC và Sài Gòn FC sẽ cách ly tối thiểu 7 ngày theo như quy định, rồi thêm 7 ngày cách ly ở nhà. Đó là chưa tính đến việc họ cần thêm thời gian để tập lấy thể lực sau khi hết thời hạn cách ly. Chắc chắn sẽ lại làm đảo lộn lịch thi đấu LS V-League.
Mới đây, CLB Hà Nội sau khi ra sân tập lại vào ngày 26-6, lãnh đạo CLB đã cho đội nghỉ thêm 10 ngày để chờ đủ quân số do nhóm đông trụ cột vừa thực hiện thêm 7 ngày cách ly tại TPHCM cùng đội tuyển quốc gia.
