Cùng thất bại ở lượt trận đầu tiên nên cả Học viện Nutifood và TPHCM đều dốc hết lực ở cuộc so tài này nhằm tránh nguy cơ ra về sớm nếu tiếp tục trắng tay. Trội hơn hẳn về lực lượng, các cầu thủ Học viện Nutifood đã tự tin áp đặt thế trận tấn công ngay từ đầu trận và dồn dập tạo nhiều pha nguy hiểm trước khung thành đội THCM.
Phút thứ 6, thế trận cân bằng đã được phá vỡ với bàn mở tỷ số của Nguyễn Quang Huy cho Học viện Nutifood. Thế trận lấn lướt cùng áp lực được khơi thông sau bàn thắng sớm, Học viện Nutifood càng đá hay hơn. Phút 15, Quốc Việt nhân đôi cách biệt trước khi Quốc Cường ghi bàn thắng thứ 3 vào phút 45.
PVF sớm giành vé đi tiếp. Sau 2 lượt đấu, cục diện tại 2 bảng A và B VCK giải bóng đá U17 Cúp Quốc gia 2020 dần được ấn định 3 đội vào Tứ kết. Ở bảng A, chủ nhà PVF chứng tỏ sức mạnh với trận thắng thứ 2, qua đó chính thức vượt qua vòng bảng sớm 1 vòng đấu. Ở bảng B, cả Viettel và Đà Nẵng đều có chiến thắng với khoảng cách tối thiểu và có được điều mình cần là điểm số thứ 6 sau lượt trận thứ 2, đồng thời cùng PVF sớm lọt vào vòng sau.
