Tham dự vòng loại có 18 đội bóng và chia thành 3 bảng. Các trận đấu vòng loại sẽ diễn ra từ ngày 2-12 đến 12-12-2021, với 5 lượt đấu vào các ngày 2-12, 4-12, 7-12, 10-12 và 12-12. Các đội trong từng bảng sẽ thi đấu vòng tròn 1 lượt tính điểm xếp hạng, chọn ra 6 đội xếp nhất, nhì của 3 bảng và 1 đội thứ 3 có thành tích tốt nhất cùng với đội đăng cai vòng chung kết sẽ thi đấu vòng chung kết.
Trường hợp đội bóng đại diện nơi đăng cai vòng chung kết có mặt trong nhóm 7 đội có thành tích tốt nhất vòng loại thì đội thứ ba có thành tích phụ tốt thứ nhì của 3 bảng sẽ giành quyền lọt vào chung kết. Vòng chung kết giải U21 quốc gia 2021 dự kiến diễn ra từ ngày 16 đến 25-12, tại trung tâm PVF.
Liên quan đến công tác chuẩn bị cho giải đấu, hôm qua VFF và Ban tổ chức giải cùng với đại diện địa phương đăng cai vòng chung kết cũng đã có cuộc họp rà soát công tác chuẩn bị và nhất là các điều kiện đảm bảo an toàn về y tế để giải có thể tiến hành thuận lợi và đảm bảo an toàn nhất.
Bảng C được xem là hấp dẫn nhất với sự hiện diện của 4 đội mạnh Viettel, SLNA, Học viện NutiFoot và Becamex Bình Dương bên cạnh hai đội Quảng Nam và Bết Tre.
Kết quả bốc thăm:
Bảng A: Hà Nội – Đông Á Thanh Hóa – HAGL – Khánh Hòa – Gia Định – Đồng Nai
Bảng B: PVF Hưng Yên – Nam Định – Đà Nẵng – Thừa Thiên Huế – TPHCM – Đồng Tháp
Bảng C: Viettel – SLNA – Học viện NutiFood – Becamex Bình Dương- Quảng Nam – Bến Tre