Ở Vòng loại thứ hai hướng tới World Cup 2022, lồng ghép với Vòng loại AFC Asian Cup 2023 vào tháng 9-2019, người hâm mộ Indonesia khiến trận đấu với Malaysia tạm dừng trên sân vận động Gelora Bung Karno ở Jakarta.
FIFA cũng đã phạt Liên đoàn bóng đá Indonesia (PSSI) khoản tiền 245.000 franc Thụy Sĩ (khoảng 6 tỷ VND) vào tháng trước cũng như ra án phạt họ thi đấu một trong những trận đấu tại nhà của họ mà không có góp mặt của khán giả. Trận đấu trên sân nhà còn lại của đội bóng xứ sở vạn đảo là tiếp đội tuyển Các tiểu vương quốc Ả rập thống nhất vào ngày 31-3-2020.
Bên cạnh đó, Liên đoàn bóng đá Malaysia (FAM) cũng bị phạt 50.000 franc Thụy Sĩ (khoảng 1,2 tỷ VND) vì sự cố của người hâm mộ trong trận đấu vòng loại World Cup với Indonesia tại sân vận động quốc gia Bukit Jalil ở Kuala Lumpur vào ngày 19-11. FIFA cũng đưa ra cảnh báo cho FAM khi huấn luyện viên trưởng Tang Cheng Hoe của họ không tham dự buổi họp báo bắt buộc sau trận đấu sau thất bại 0-1 trước Việt Nam tại Hà Nội vào ngày 10-10-2019.
