Lopetegui nhận lời dẫn dắt Sevilla từ tháng 6-2019, sau 8 tháng nghỉ ngơi khi bị Real Madrid sa thải vào tháng 10-2018. Và ngay trong mùa giải đầu tiên, Lopetegui đã hoàn toàn rũ bỏ nỗi thất vọng từ những nhiệm kỳ trước đó, bao gồm tại tuyển Tây Ban Nha, khi tận hưởng chức vô địch UEFA Europa League (lần thứ 6 của Sevilla, đánh bại Inter Milan trong trận chung kết). Bên cạnh thành công ở Europa League, Lopetegui cũng giúp đội giành quyền tham dự Champions League.
Sevilla đã lưu ý trong tuyên bố của họ về việc gia hạn hợp đồng, rằng Lopetegui là HLV có tỷ lệ chiến thắng cao nhất trong lịch sử CLB. Trong khi Monchi, Giám đốc thể thao của CLB, cảm ơn Lopetegui vì tài năng và sự chuyên nghiệp. Còn bản thân Lopetegui thì vui mừng trong thời điểm gia hạn: “Đó là một động lực rất lớn. Chúng tôi muốn Sevilla vĩ đại hơn nữa. Sẽ phải mất rất nhiều công sức để biến giấc mơ của các CĐV Sevilla thành hiện thực”.
Sau chiến thắng 3-2 trước Real Sociedad vào thứ Bảy, HLV Lopetegui đã đạt 100 điểm kể từ khi tiếp quản Sevilla. Trong thời gian dẫn dắt CLB, cựu HLV Real sở hữu thành tích ấn tượng với 46 trận thắng sau 79 trận chính thức (chỉ phải chịu 14 trận thua). Kể từ khi đến, nhà cầm quân người xứ Basque bất bại 82% số trận mà ông đã dẫn dắt.
Thỏa thuận này sẽ là tin tức đáng hoan nghênh khi Sevilla muốn đẩy mạnh một vị trí châu Âu tại La Liga cũng như chơi tốt hơn ở Champions League. Hiện tại, Sevilla đứng thứ 6 tại La Liga (kém 2 điểm so với đội thứ 4 Villareal, nhưng còn chơi ít hơn 2 trận), và sẽ đối mặt với Borussia Dortmund ở vòng 1/8 Champions League.