Chặng 3 từ Almodôvar đến Faro dài 211,4km với địa hình lên xuống liên tục. Tuy nhiên, những nỗ lực tấn công của Ineos Grenadiers, Alpecin–Fenix, Astana Qazaqstan,… đều bị những đội đang nắm giữ các danh hiệu cao quý như Groupama–FDJ (có David Gaudu đang giữ áo vàng cá nhân tổng sắp và áo xanh dương tổng sắp dành cho vua leo núi), Quick-Step Alpha Vinyl (có Fabio Jakobsen đang giữ áo xanh lá cây tính điểm tổng sắp) hoá giải.
Khi cấn vào chân ngọn đèo cuối cùng của chặng cách đích khoảng 40km, một nhóm 7 tay đua ít có khả năng tranh chấp thứ hạng cá nhân cao đã thoát đi với khoảng cách gần 1 phút. Tuy nhiên, Alpecin–Fenix không có đại diện nào ở nhóm đầu nên đã phối hợp các đội mạnh đuổi theo. Kết quả là đoàn đua đã nhập lại thành một toán chính khi còn cách đích khoảng 10km.
Từ đó bắt đầu một cuộc giằng co rất dữ dội khi các đội sở hữu những chân rút mạnh đều muốn chiếm giữ vị trí thuận lợi. Sau chặng thứ hai đèo dốc gần như “mất tích” và để đánh rơi áo vàng về tay David Gaudu, toàn đội Quick-Step Alpha Vinyl dốc toàn lực giúp Fabio Jakobsen bảo vệ áo xanh lá cây.
“Máy kéo” rất mạnh Remco Evenepoel được phân công chạy đầu đoàn đua để tạo tốc độ cho Fabio Jakobsen. Và trong 200m cuối, tay đua người Hà Lan lao lên như một mũi tên vượt qua Tim Merlier (Alpecin-Fenix) và Bryan Coquard (Cofidis) để về đích đầu tiên với thời gian 4 giờ 54 phút 51 giây.
Chiến thắng này giúp Fabio Jakobsen cũng cố vững chắc chiếc áo xanh lá cây tổng sắp với 50 điểm, hơn 14 điểm so với người thứ hai Bryan Coquard (Cofidis). Tay đua Bồ Đào Nha João Matias (Tavfer-Mortágua-Ovos Matinados) tạm giữ áo xanh dành cho vua leo núi với 12 điểm.
