Trước khi được bổ nhiệm làm Tổng thư ký LĐBĐ Việt Nam, ông Nguyễn Văn Phú đang đảm nhiệm vị trí Phó Ban Y học và Trưởng phòng Y học thể thao LĐBĐ Việt Nam. Ông Nguyễn Văn Phú được đánh giá là người có bề dày kinh nghiệm trong công tác quản lý khi từng đảm nhiệm các chức danh: Trưởng khoa Y học thể thao-Vật lý trị liệu, Bệnh viện Thể thao Việt Nam; Bí thư chi bộ các khoa Lâm sàng, Đảng bộ Bệnh viện Thể thao VN; Phó giám đốc Bệnh viện Thể thao; Bí thư Chi bộ, Giám đốc Trung tâm Doping và Y học thể thao.
Ông Nguyễn Văn Phú cũng được biết đến là một trong những cán bộ tham gia tích cực vào hoạt động bóng đá quốc tế trên vai trò Ủy viên Ban Y học LĐBĐ châu Á (AFC) và nhiều sự kiện chuyên môn về Y học thể thao trong nước và quốc tế.
Ông Nguyễn Văn Phú chính thức bắt đầu công việc trên cương vị Tổng thư ký LĐBĐ Việt Nam từ ngày 23-11-2024 cho đến hết nhiệm kỳ của LĐBĐ Việt Nam khóa IX. Quyết định này đã chính thức được thông báo tại Đại hội thường niên LĐBĐ Việt Nam năm 2024, diễn ra sáng nay (22-11).