Tham dự giải bóng đá hạng Nhì Quốc gia năm 2019 có 14 đội bóng, trong đó có 10 đội hạng Nhì Quốc gia 2018 gồm: Nam Định; Kon Tum; Lâm Đồng; Fishsan Khánh Hòa; Bình Thuận; Bà Rịa Vũng Tàu; Tiền Giang; Bến Tre; Long An; Vĩnh Long; 3 đội hạng Ba mới thăng hạng là Trẻ Hà Nội; Gia Định; Trẻ Đà Nẵng và CLB Công an Nhân dân – đội bóng xuống từ hạng Nhất quốc gia 2018.
Kết quả tiến hành chia bảng như sau, bảng A gồm Công an Nhân dân, Trẻ Hà Nội, Nam Định, Trẻ Đà Nẵng, Kon Tum, Lâm Đồng và Fisshan Khánh Hòa. Bảng B gồm Bình Thuận, Gia Định, Bà Rịa – Vũng Tàu, Long An, Tiền Giang, Bến Tre và Vĩnh Long.
Tương tự như mọi năm, việc tiến hành chia bảng được xếp theo địa lý để giảm chi phí cho các đội trong việc di chuyển, bởi hầu hết các đội hạng Nhì đều không mạnh về kinh phí. Các đội sẽ đá vòng tròn theo thể thức lượt đi và lượt về (sân khách và sân nhà) để tính điểm, xếp hạng. 2 đội có thứ hạng cao nhất tại mỗi bảng sẽ tham dự VCK. Một đội có điểm, chỉ số phụ thấp nhất trong hai bảng sẽ phải xuống hạng.
Tại VCK, 4 đội sẽ được chia thành 2 cặp đấu bán kết (nhất bảng A gặp nhì bảng B và nhất bảng B gặp nhì bảng A). Hai đội thắng bán kết tiếp tục gặp nhau trong trận chung kết. Các trận đấu ở VCK thi đấu theo thể thức loại trực tiếp một trận, nếu sau thời gian thi đấu chính thức (90 Phút) tỷ số hòa, 2 đội sẽ thi đá luân lưu 11m để xác định đội thắng (không thi đấu thêm trận đấu phụ).
Đáng chú ý là năm nay chỉ có 1 suất thăng hạng dành cho đội vô địch. “Cửa” hẹp, hy vọng sẽ tăng chất lượng cho giải đấu.