Theo mã số hạt giống đã được ấn định trước, hai đội U23 Việt Nam và U23 Thái Lan được phân vào hai bảng. Qua đó, U23 Việt Nam cùng bảng A với các đội Indonesia, Myanmar, Philippines và Timor Leste. Bảng còn lại gồm Thái Lan, Malaysia, Campuchia, Singapore và Lào.
Như vậy ngay từ vòng đấu bảng môn bóng đá nam đã tái hiện trận chung kết SEA Games 30 giữa Việt Nam và Indonesia. Sẽ là thử thách lớn cho đội chủ nhà khi U23 Indonesia vốn đã sớm đi vào chuẩn bị ngay sau khi kết thúc SEA Games 30. LĐBĐ Indonesia đã mạnh dạn đưa nhiều cầu thủ trẻ vào đội tuyển quốc gia để tham dự vòng loại thứ 2 World Cup 2022 cũng như AFF Cup 2021.
Để chuẩn bị cho SEA Games 31, VFF đã công bố danh sách tập trung với 27 cầu thủ. Đây là danh sách mở bởi theo quy định thì danh sách sơ bộ của các đội lên đến 50. Ngoài ra, ông Park Hang-seo cũng chưa chốt danh sách 3 cầu thủ trên 23 tuổi tham dự SEA Games 31.