Chặng 5 diễn ra vào sáng 9-9, từ Vị Thanh (Hậu Giang) đi Long Xuyên (An Giang) dài 120km, tay đua Trần Văn Quyền (QK7) xuất sắc cán đích đầu tiên với thời gian 1 giờ 54 phút 56 giây (tốc độ trung bình 44,379km/giờ), về nhì là Lê Văn Duẩn (BVTV SG1), hạng ba là Lâm Công Danh (BVTV AG).
Trước chặng này, do có cùng thời gian với áo vàng Đinh Quốc Việt (Domesco Đồng Tháp) nên Lê Ngọc Thanh (BVTV SG1) được sự hỗ trợ của đồng đội tích cực thu gom những điểm thưởng dọc đường. Cuối cùng, Lê Ngọc Thanh thành công giành áo vàng từ tay Đinh Quốc Việt. Chặng 6 vòng quanh thành phố Long Xuyên sau đó không tính vào tổng sắp nên Lê Ngọc Thanh (BVTV SG1) giành áo vàng chung cuộc.
Tay đua Bùi Minh Thụy (Vĩnh Long) giành áo xanh chung cuộc với 14 điểm. Quân khu 7 giành giải nhất đồng đội, hạng nhì là Bảo vệ thực vật Sài Gòn và hạng ba là Domesco Đồng Tháp.
G.M.